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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

共生共情共享，让文化遗产绽放璀璨光芒******

文化遗产与我们共生于这个时代；我们共享着它的博大与优雅；跨越千百年，它承载的智慧与情感依然能让我们找到共情的地方——一个字、一封信，让我们找到民族的起点、情感的归宿；一尊鼎、一座城，让我们见证历史的变迁、时代的更迭。

“兄行，弟病，诸君幸为……”这是2000年前在行役戍边的哥哥写给老家弟弟的一封家书，今天的我们依然能从字里行间体会当事人的呼吸与情怀；川蜀小堆盲盒、金面具巧克力、语音棒棒糖等三星堆文创，带给文博铁粉无尽的快乐，三星堆已然成为一个掌握了流量密码的大IP；甲骨文和简化字的双标展示、3.6万多套道路窨井盖上的甲骨文字装饰等，让河南安阳大街小巷随处可见甲骨文元素……《工人日报》近期推出的《发光吧，文化遗产》系列报道，关注文化遗产如何在当代生活中活起来、火起来、发光发亮，在新时代绽放新光彩的故事，从三星堆到黄河文物、从陆上考古到水下考古等，完成了一场与文化遗产跨越时空的对话。

记得网上有人调侃走进博物馆看到文化遗产时发出的灵魂三问：“哪儿好看？”“值多少钱？”“有啥用？”调侃之外，这也透露出今天的人们试图与文化遗产发生情感共鸣、生活互动、文化呼应的朴素愿望。如何让更多文化遗产能够在新的时代活起来、火起来，如何让沉睡在书本里、保管箱里的文化遗产“飞入寻常百姓家”，是我们面临的新课题。

我们欣喜地看到，各地文化遗产保护一步步推进。重庆母城保留了原有的建筑风貌，成为网红打卡点；简牍跨越千年，仍然能够让今天的我们真切感受到当年一个个活生生的人及其日常生活片段；文物保护工作辛苦，却依然有一代代人心向往之，随着科技的发展，3D打印、数字建模、生物涂层等高科技手段已经开始在文物及文化遗产保护中大展拳脚；更有周边文创产品，让年轻人蹲守抢购。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）